La mostra principale sul tema “Città, architettura e società” sarà quest'anno abbinata alla mostra “Città di pietra” a Venezia e alla mostra “Città portuale” a Palermo.
La novità di quest'anno sarà lo svolgimento della principale cerimonia di premiazione al termine della Biennale, l'8 novembre 2006. Contestualmente verranno premiati i vincitori del Premio Leone di Pietra - principalmente sezione veneziana, e del Premio Portus di architettura - nella sezione Palermo. Nella giornata di apertura, il 10 settembre, solo Richard Rogers riceverà il Leone d'Oro per il suo contributo fondamentale allo sviluppo dell'architettura …
Partner della Biennale quest'anno è Risanamento SpA, che sta realizzando a Milano i nuovi quartieri di Santa Giulia (architetto Norman Foster) e dell'ex zona industriale Falk (architetto Renzo Piano). Presenterà la sua mostra a Venezia dedicata a questi progetti. La mostra è anche sostenuta dalle aziende "Inarcassa" e "illycaffè". L'azienda Targetti, in collaborazione con la Biennale, ha installato un sistema di illuminazione creativa per il Padiglione Italia, alcuni altri spazi espositivi a Venezia e tutte le mostre a Palermo.