L'edificio sarà situato in zona Isola per due motivi. In primo luogo, la sua costruzione farà parte dell'attuazione del programma "Porta Nuova" per il rilancio di questa parte di Milano e la rigenerazione delle zone industriali dismesse ivi situate. Ma ancora più importante, è stato in quest'area di lavoro che il movimento di resistenza partigiana è stato particolarmente forte durante la seconda guerra mondiale e la "Casa della Memoria" diventerà un centro culturale dedicato ai combattenti per la libertà e alle vittime del terrore di tutti i colori e sfumature. Vi saranno ubicate le sedi di diversi enti pubblici, in particolare l'Associazione Partigiani Italiani, l'Associazione Ex Prigionieri dei Campi di Concentramento, l'Istituto per la Storia del Movimento di Liberazione, l'Associazione Italiana Vittime del Terrorismo, e varie associazioni di parenti delle vittime di attacchi terroristici. "Casa della Memoria" non diventerà un altro museo commemorativo, ma una sorta di "laboratorio della libertà", dove si terranno costantemente conferenze, seminari e mostre. Ci sarà un archivio di documenti e materiali video, una biblioteca e un centro per materiali didattici per le scuole. Lo scopo del centro è quello di resistere all '"amnesia collettiva" della società e alla politica del revisionismo in relazione ad eventi del passato di vario grado di prescrizione - sia il regime di Mussolini o l'occupazione nazista, sia l'attacco terroristico a Piazza Fontana a Milano, commesso nel 1969 da neofascisti.
Il progetto di Boeri è un mattone di vetro, al quale conduce un'ampia rampa. Questa rampa prosegue all'interno dell'edificio: collega tutti i suoi piani, passando lungo la sua facciata. Lo zigzag da lui creato conferisce dinamicità all'intera composizione dell'edificio. Sull'ala della facciata è prevista la collocazione di varie immagini e testi legati al tema degli eventi che si svolgono nella "Casa della Memoria". Il tetto del centro sarà trasformato in una piattaforma di osservazione, da cui si aprirà la vista di tutta Milano.
