Il progetto è partito nel 2001: nel 1999 il controllo del Canale di Panama è stato trasferito dagli Stati Uniti alle autorità panamensi, e contemporaneamente è sorta la questione del nuovo uso dei territori adiacenti. Una delle sezioni - precedentemente occupata dalla base aerea americana - è stata destinata ad un museo. La costruzione è iniziata nel 2006, ma è stato solo all'inizio di questo ottobre che Biomuseo ha aperto al pubblico - anche se non ancora del tutto: diverse sale e un acquario non saranno pronti fino all'inverno 2016.
Con il suo tetto in alluminio colorato, il museo dovrebbe ricordare la natura vibrante di Panama, i tetti metallici delle capanne locali e le strutture storiche dell'infrastruttura del canale. Situato su una stretta penisola che sporge nella baia, l'edificio è visibile da lontano e può offrire ai suoi visitatori viste panoramiche sulla città e sulla "foce" del Pacifico del Canale di Panama.
La durata della costruzione del museo, soprannominato dalla gente del posto "il museo che non sarà mai completato", è spiegata, tra l'altro, dalle basse qualifiche dei costruttori locali. Il calcestruzzo grezzo dei pavimenti e delle pareti è stato versato più volte e anche il tetto con tolleranze di 6 mm ha presentato molte difficoltà.
Tuttavia, ora il museo non solo è stato costruito con successo, ma è quasi completamente riempito con la mostra "Il ponte della vita", progettata da Bruce Mau. La Smithsonian Institution di Washington era responsabile della parte scientifica del progetto e Biomuseo divenne il suo unico museo partner al di fuori degli Stati Uniti.
Il museo è dedicato alla straordinaria diversità naturale dell'istmo di Panama: con una superficie di 75.000 km2, ospita più specie di uccelli, mammiferi, rettili e piante che negli Stati Uniti e in Canada messi insieme. Inoltre, l'esposizione racconta in dettaglio il processo di formazione dell'istmo, iniziato 12 milioni di anni fa e terminato 3 milioni di anni fa. Il suo aspetto ha cambiato gli ecosistemi e il clima su scala planetaria: invece di un singolo oceano, sono sorti un Atlantico e un Pacifico molto diversi, la Corrente del Golfo "è partita" dall'emergente Mar dei Caraibi e il Nord e il Sud America si sono uniti per la prima volta in 70 milioni. anni. Una migrazione attiva di animali iniziò lungo l'istmo e, relativamente di recente, 15.000 anni fa, le prime persone attraversarono questa rotta da nord a sud.
Biomuseo, che costa 95 milioni di dollari (senza contare i costi dei padiglioni espositivi non ancora finiti), è pensato principalmente per gli scolari (si prevede di portare lì 40.000 studenti all'anno per escursioni gratuite) e per i turisti, poiché il terminal delle navi da crociera è molto vicino. Idealmente, le autorità si aspettano l '"effetto Bilbao" dal museo. Secondo il loro piano, dovrebbe diventare lo stesso simbolo di Panama-City e Panama-Country, che l'Opera House di Utson è diventata per Sydney e l'Australia.