Il complesso museale ha acquisito due nuovi piani superiori, oltre a una facciata giallo brillante di 8 milioni di piastrelle di ceramica. Il compito dell'architetto e della direzione del museo era di trasformare il più antico museo per bambini del mondo (è stato aperto per la prima volta nel 1899) in un moderno centro educativo, focalizzato non solo sul pubblico dei bambini e funge anche da "centro comunitario" per i residenti di Brooklyn.
L'edificio ristrutturato dispone di una biblioteca, nuove sale espositive, caffè e aule. La terrazza sul tetto con un teatro estivo, che esiste dal 1970, è ora più strettamente collegata al resto dell'edificio grazie a nuove scale e atri. Ringhiere e finestre aggiuntive su un livello più basso del solito, altri dettagli interni ricordano ai visitatori che questo edificio è progettato principalmente per i bambini; e che le sue sale sono piene non solo di curiosi manufatti delle scienze storiche e naturali, ma anche di giocattoli e attrazioni, inclusa una sabbiera con sabbia azzurra.
Il Brooklyn Children's Museum è destinato a diventare il primo museo nello Stato di New York a ricevere una certificazione energetica LEED d'argento: i pozzi geotermici vengono utilizzati per riscaldare e raffreddare l'edificio, i pannelli solari sono installati sulle facciate e gli eco-sensori regolano l'illuminazione e la ventilazione sistemi.
