Il Naturalis Biodiversity Center è l'erede del Museo di Storia Naturale, fondato per ordine del re Guglielmo I dei Paesi Bassi nel 1820 e da allora ha subito diverse trasformazioni, la principale delle quali avvenne all'inizio degli anni 2010: il Museo Zoologico di l'Università di Amsterdam e l'Erbario Nazionale, uno dei più grandi al mondo. Di conseguenza, è emerso un centro educativo e di ricerca, la cui collezione (42 milioni di articoli) è una delle cinque più grandi collezioni di scienze naturali del pianeta.
Allo stesso tempo, la popolarità di "Naturalis" tra il grande pubblico è cresciuta solo, con 400.000 persone all'anno, quindi l'edificio che ha aperto nel 1998 ha dovuto essere prontamente ampliato e ricostruito. Gli architetti di Neutelings Riedijk hanno collocato al centro un ampio atrio, che collega i locali di deposito e amministrativo esistenti con il nuovo museo e moderni laboratori per oltre 200 ricercatori. L'area totale dell'istituto è di 38.000 m2, di cui 18.000 m2 di ricostruzione e 20.000 di nuova costruzione.
La facciata dell'atrio è una composizione ornamentale in cemento di ovali e triangoli, che ricorda la struttura delle molecole. Lo stesso motivo è posto sui pavimenti. All'interno, è rivestito in travertino rosso, intervallato da 263 pannelli di cemento disegnati dalla stilista Iris van Herpen. Al cemento bianco è stata conferita la morbidezza della seta per evocare gli abiti futuristici di Van Herpen e le fantasie sono ispirate agli articoli della collezione Naturalis. La stessa struttura a strisce è sulle facciate dell'edificio.
Insieme ai luccicanti cristalli di travertino, i pannelli bianchi creano l'impressione di strati di roccia contrastanti. La somiglianza è accentuata dal percorso affusolato che attraversa l'atrio, dalla sala espositiva e dai laboratori al piano terra alle gallerie al piano superiore.
Anche l'atrio è decorato con opere del designer Tord Boontje. Di solito si occupa di mobili, lampade e tessuti fantasia, e per Naturalis ha realizzato quasi un centinaio di boiserie "sulle meraviglie della natura", unendo motivi grafici e fotografici.
